Witamy
Witamy na stronach grupy naukowej zajmującej się toksykologią obliczeniową - Computational Toxicology Group. W portalu publikujemy wyniki naszych prac, oferujemy bezpłatny dostęp do toksykologicznych baz danych oraz algorytmów stworzonych przez członków Grupy.
Strona podzielona jest na dwie części - dostępną publicznie oraz chronioną hasłem. Aby uzyskać dostęp do części chronionej wystarczy zarejestrować konto użytkownika korzystając z linku widocznego po lewej stronie. Po utworzeniu konto musi zostać odblokowane przez administratora systemu, co może trwać maksymalnie kilka dni. Aktywny użytkownik ma pełen, bezpłatny dostęp do całej zawartości systemu tox-porta.net.
Stabilna wersja 1.1 systemu ToxComp została opublikowana!
Z przyjemnością informujemy, że opublikowana została stabilna wersja 1.1 systemu ToxComp. Platforma ToxComp wykorzystywana jest do ekstrapolacji in vitro - in vivo efektu kardiotoksycznego leków oraz populacyjną ocenę tego zjawiska. Ten ostatni element pozostaje naszym głównym obszarem zainteresowań i w związku z tym nowa wersja zawiera elementy pozwalające dokładnie definiować parametry wpływające na zmienność międzyosobniczą w populacji. Dokładna lista nowych funkcji jest dostępna w Dzienniku zmian.
Aby uruchomić wersję on-line lub pobrać wersję lokalną po rejestracji i zalogowaniu się do systemu proszę wybrać zakłądkę ToxComp dostępną w menu po lewej stronie. W tym miejsceu można również znaleźć listę nowości w wersji 1.1 systemu. Szczegółowa instrukcja obsługi jest dostępna w dziale Repozytorium. Bardzo prosimy o wszelkie uwagi i komentarze!
Materiały z warsztatów CPW 2011 są już dostępne
Wykłady i pozostałę materiały multimedialne zarejestrowane w trakcie warsztatów 3rd International Workshop - Computational Pharmacy są już dostępne. Zapraszamy.
Stabilna wersja 1.0 systemu ToxComp została opublikowana!
Z przyjemnością informujemy, że opublikowana zostałą stabilna wersja 1.0 systemu ToxComp. Platforma ToxComp wykorzystywana jest do ekstrapolacji in vitro - in vivo efektu kardiotoksycznego leków oraz populacyjną ocenę tego zjawiska.
Aby uruchomić wersję on-line lub pobrać wersję lokalną po rejestracji i zalogowaniu się do systemu proszę wybrać zakłądkę ToxComp dostępną w menu po lewej stronie. W tym miejsceu można również znaleźć listę nowości w wersji 1.0 systemu. Szczegółowa instrukcja obsługi jest dostępna w dziale Repozytorium. Bardzo prosimy o wszelkie uwagi i komentarze!
Materiały z warsztatów w Berlinie są dostępne
Materiały prezentowane oraz studia przypadków dyskutowane w trakcie 3rd Predicitive Toxicology meeting w Berlinie są już dostępne do pobrania.
Wersja beta platformy ToxComp dostępna on-line
Z przyjemnością informujemy, że wersja beta platformy ToxComp jest już dostępna on line. Tox-Comp to system stworzony w celu ekstrapolacji in vitro - in vivo wyników pomiarów blokowania prądów jonowych w komórkach serca.
Aby włączyć system zaloguj się i przejdź do zakładki ToxComp. Szczegółowa instrukcja obsługi dostępna jest w zakładce Repozytorium. Czekamy na wszelkie uwagi związane z działaniem systemu!
Nowa wersja zbioru danych inhibicji kanału hERG
Opublikowana została nowa wersja zbioru danych opisujących blokowanie kanału hERG! Pliki (w formacie .xlsx oraz .ods) są możliwe do pobrania w dziale Repozytorium, dostępnym dla zarejestrowanych użytkowników. Opisywana baza danych jest największym dostępnym bezpłatnie zbiorem informacji opisujących blokowanie kanału hERG przez leki. Pobrane z literatury wyniki doświadczeń in vitro prezentowane są w postaci wartości IC50 dla 263 molekuł opisanych w 642 rekordach.
Prezentacje wyników prac zespołu
Członkowie zespołu będę prezentować wyniki badań w trakcie zbliżających się konferencji:
Mini-symposium Computational toxicology and pharmacology - in silico drug activity and safety assessment (Saturday, July 2, 11:00) during the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology and Annual Meeting of The Society for Mathematical Biology; June 28 - July 2 2011; Krakow, Poland
Znacząca aktualizacja systemu!
W dziale Oprogramowanie opublikowano opis oraz odnośnik do programu umożliwiający ocenę potencjału hamowania prądu jonowego w kanałach potasowych hERG. W dziale Repozytorium (dostępna po zarejestrowaniu) umieszczono bazę danych inhibitorów kanału hERG. Pliki (.xlsx lub .ods) zawierają informacje dostępne w publikacjach naukowych.
Polska wersja portalu
Uruchomiona została polska wersja portalu tox-portal.net - zapraszamy.